Genômica Clínica e Funcional - Pesquisa Clínica

As SPHC acometem cerca de 10% dos pacientes com câncer, sendo que esta porcentagem pode variar entre aqueles com tumores de mama, colorretal, melanoma e gástrico, dentre outros. Além disso, as características clínicas de pacientes suspeitos de câncer hereditário podem variar em diferentes populações. Assim, estudos em SPHC são extremamente relevantes, pois tanto o reconhecimento do paciente em risco de ser portador de uma variante genética de predisposição ao câncer, como a adoção de medidas de prevenção e diagnóstico precoce, são de importância ímpar para os pacientes oncológicos. Nessa área, o grupo vem desenvolvendo projetos científicos em vários frentes, tais como: identificação dos pacientes portadores de SPHC através de rastreamento de genes conhecidos; estudos para classificação de variantes genéticas raras em genes já conhecidos e para as quais não há definição quanto ao potencial patogênico; identificação de novos genes associados a SPHC; fatores genéticos que podem modular o risco de pacientes portadores desenvolverem tumores, dentre outros. Os dados gerados são avaliados de forma integrada, considerando os aspectos clínicos, epidemiológicos e moleculares. Para isso, o grupo trabalha com estreita colaboração com os departamentos clínicos e com outros centros de pesquisa nacionais e internacionais.

A oncologia personalizada ou de precisão apresentou avanços extraordinários nos últimos anos com a utilização do sequenciamento de próxima geração (NGS) e, atualmente, é uma disciplina crucial tanto no cenário científico como clínico na área da oncologia. A descoberta de alterações genéticas e moleculares associadas ao desenvolvimento e progressão do câncer, assim como a identificação dessas alterações para embasar a decisão clínica na escolha e dose do tratamento, fazem parte das descobertas nessa área. Assim, o grupo desenvolve e estabelece ferramentas genômicas e moleculares para detectar alterações de potencial relevância em vários tipos de câncer. Os dados genéticos e moleculares gerados, junto com os dados clínicos, são trabalhados de forma interdisciplinar com a equipe de patologistas, oncologistas clínicos e médicos de outras especialidades para gerar conhecimento na área. Os principais tipos de tumores analisados são colorretal, mama, melanoma, ovário e pulmão, dentre outros. Especificamente para tumores colorretais, o grupo investiga variantes genéticas associadas com metabolização e toxicidade aos principais fármacos usados no tratamento desse tipo de tumor, a fim de estabelecer associações que vislumbram, no futuro, embasar as decisões clínicas na prescrição do tipo e da dosagem do fármaco para um tratamento mais eficiente e personalizado.

A eficácia das terapias disponíveis para o tratamento do câncer, incluindo a quimioterapia convencional e as chamadas terapias-alvo, varia amplamente entre os pacientes. Uma das razões para a variação observada é que cada tumor apresenta um repertório genético altamente heterogêneo, composto de clones de células com diferentes perfis de mutação. Consequentemente, durante o tratamento, a arquitetura mutacional do tumor pode mudar substancialmente, uma vez que as células tumorais podem apresentar sensibilidades distintas ao fármaco utilizado. Atualmente, por meio de um método conhecido como análise do DNA tumoral circulante (ct-DNA), o grupo tem condições de acessar essas modificações no repertório mutacional do DNA livre no plasma do paciente, uma vez que fragmentos do DNA tumoral são derramados na corrente sanguínea. Esse método denominado de biópsia líquida - ctDNA permite investigar os mecanismos genéticos de resistência durante o tratamento. Outros fluidos corpóreos também são analisados em projetos do grupo, como escarro, líquor (líquido cefalorraquidiano), urina e outros, dependendo do tipo de tumor analisado.

Um dos focos da área de biologia tumoral é em genes de predisposição ao câncer, como a mutação no gene MUTYH1 e sua influência na predisposição do câncer colorretal, de mama e gástrico. Em câncer de mama, temos uma linha de pesquisa para tumores do subtipo triplo negativo (TN), um grupo agressivo e em que aproximadamente 15% dos pacientes são portadores de mutação germinativa no gene BRCA1. O grupo tem estudado de forma integrada os aspectos genômicas e moleculares, tanto dos pacientes como dos tumores, levando em consideração a ancestralidade, a predisposição genética ao câncer e a eficiência do tratamento. Ainda em câncer de mama, desenvolve projetos para entender mecanismos de invasão de lesões in situ com o objetivo de desenvolver assinaturas gênicas capazes de predizer o risco de progressão dessas lesões. O grupo, utilizando a genômica como ferramenta de investigação, também desenvolve projetos de interesse clínico por meio de colaborações com médicos de diversas especialidades. Nessa linha, desenvolve projetos em tumores raros (como os tumores de Wilms, sarcomas e tumores neuroendócrinos) e hematológicos, dentre outros.